中國科學院昆明植物研究所前身是靜生生物調查所和云南省教育廳于1938年7月合作成立的云南農林植物研究所。1950年4月轉屬中國科學院,更名為中國科學院植物分類研究所昆明工作站。1953年3月更名為中國科學院植物研究所昆明工作站。1959年4月,經國家科委批準,正式成立中國科學院昆明植物研究所。研究所將植物分類與生物地理、植物化學與天然產物研發、野生種質資源保藏與利用、民族植物學與區域發展、資源植物研發與產業化這五個方面為重點研究領域。
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